茄子茎基腐病从定植到收获均可发生，主要危害植株茎基部或地下主、侧根。初发病外部无明显变化，后病斑呈暗褐色，绕茎基扩展，致使皮层腐烂。地上部叶片变黄，植株最初叶片从下向上逐渐菱，似缺水状，数日后叶片由下向上逐渐发黄，全株叶片菱鷔，叶片灰绿，不能恢复常态，果实膨大后，因养分供应受阻逐渐菱蔫枯死，叶片多残留在枝上不脱落，后期病部表面常形成黑褐色大小不一的菌核。

防治方法一是苗床消毒。选择连续多年未种过茄果类蔬菜的肥沃田园土或基质做床土育苗，添加充分腐熟、过筛的有机肥。用665％霜霉威水剂拌药土消毒，每立方米床土用药80克，或每4～5千克细土加入药剂10克。播种时，1/3在苗床上，2/3播后盖在种子上面。

二是棚室消毒。硫磺蒸，每667米2用硫磺3千克加木屑6千克，分堆点燃，蒸1夜，然后打开棚膜放风3～5天。或播前2～3周，用40％甲醛150倍液浇床土，然后用薄膜覆盖4～5天，耙松床土，然后播种是培育壮苗。选择地势高燥、平坦地块育苗，加强苗床管理，注意提高地温，科学放风，防止苗床或苗盘出现高温高湿环境。

育苗时，播种密度不可过大，夏季育苗要及时分苗，防止幼苗徒长，培育壮苗。四是高温阿棚。合理规划种植茬口，一般在下茬作物定植前1个月及时拉秧，清理残枝败叶，深耕、浇水，然后将棚室扣严，进行高温闷棚，一般晴好天气15～20天即可。

五是科学管理。采用配方施肥技术，减少化肥使用量；及时整枝打权，增加田间通风透光；浇透定植水，缓苗后，适当控制浇水和追肥，坐果后适当增加肥水，防止忽干忽湿，忌大水漫灌，保持植株表面的土壤疏松。高温有利于此病的发生蔓延，要控制温度尽量不要超过30℃，以防加重病情。六是药剂防治。